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发布时间:2018-09-06 20:18:00
西农成功参与破译世界首个六倍体小麦基因组图谱
西安墙体广告 作为世界各地最为广泛种植的谷物之一,相较于其他作物,小麦是唯一一个尚未完成全基因组测序的物种。8月17日,《科学》杂志在线刊发了相关论文,标志着世界首个六倍体小麦基因组图谱完成。论文由国际小麦基因组测序联盟协作完成,西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室宋卫宁教授团队作为中国唯一参与并承担实质性研究工作的团队,完成了其中7DL染色体物理图谱构建及序列破译工作。
据了解,小麦之所以尚未完成全基因组测序,是因为小麦的基因组体量庞大,是人类基因组的5倍,是水稻基因组的40倍,同时又是作为典型的异源多倍体基因组,重复序列极高。为了实现获得面包小麦的高质量基因组序列愿景,2005年开始,国际小麦基因组测序联盟将普通小麦品系“中国春”的21条染色体进行了分离,并构建了相应的细菌人工染色体文库,后续的物理图谱构建、细菌人工染色体测序和序列的组装与分析则由联盟各成员分担。
据了解,在国外期间,宋卫宁就积极与国际小麦基因组测序联盟磋商,2006年,宋卫宁全职来西北农林科技大学农学院工作,同年7月他正式加入该联盟,并成为联盟决策委员会唯一中国成员。2009年,西农为宋卫宁团队提供了500万元科研经费,购买测序仪等大型实验设备,建设小麦基因组学科研平台,大力支持其团队开展小麦7DL染色体物理图谱构建工作。
宋卫宁介绍,小麦7DL染色体物理图谱构建及序列破译工作是一个全新的探索,无经验可循,仅7DL染色体的大小,就相当于整个水稻基因组。但物理图谱构建及序列组装、分析和破译的工作量,要远远超过相应的水稻基因组。
“参与的师生数量可以坐满一节车厢了。”他表示,在此过程中,团队成员全力投入海量数据的测序和破译工作,经过近10年的不懈努力,终于完成了7DL染色体物理图谱构建及序列破译工作。
8月17日,《科学》杂志在线刊发题为《Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome》的论文。世界首个六倍体小麦基因组图谱完成,可以说是获得了研究小麦的一个密码本,有一种说法,称此项工作标志着征服了遗传学的“珠穆朗玛峰”,可帮助科研人员更好地掌握小麦生长发育的规律。
记者了解到,该研究工作是国际大协作的结晶,作者有200多人,隶属20多个国家的70多个单位。宋卫宁团队不但负责了7DL染色体的分析工作,还参与了小麦全基因组两种不同物理图谱分析结果的整合。“未来,我们还将继续开展序列分析工作,将小麦基因组的进化、序列与分子育种、遗传育种结合起来,培育高产、抗旱、抗盐、抗病虫的小麦新品种,为小麦基因组改良工作奠定基础。”宋卫宁表示。
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